باکتری ها به دلیل ساختار ژنتیکی خود انواع مختلفی دارند. گاهی این اختلاف به حدی است که می توان دو باکتری را با 30% اختلاف ژنتوتیپی(ژنتیکی) دو گونه جدا از هم نامید. زمانی که این اختلاف ژنتیکی به کمتر از 12% کاهش یابد دو باکتری متعلق به یک گونه می باشد که به آن سوش باکتری می گویند.
باکتری استپتوکوک پونومونیه Streptococus pneumoniae که به نام پونوموکوکوس و S. pneumoniae نیز شناخته می شود، یک باکتری گرم مثبت کروی است که اغلب به صورت جفت(دیپلو کوک) یافت می شود. S.pneumoniae به طور معمول به صورت بدون علامت در دستگاه تنفسی، سینوس ها و حفره های بینی افراد ناقل سالم وجود دارد که با تضعیف شدن سیستم ایمنی باعث ایجاد عفونت و بیماری ذات الریه و مننژیت گردد.